В 1970 году Александр Иванович получил ученую степень доктора сельскохозяйственных наук, затем и звание профессора. С 1971 года занял должность заместителя директора по научной работе ВНИИ животноводства, директором ВНИИ племенного дела и руководителем селекционного центра по холмогорской породе скота (1980 -1999 год). Научную деятельность Александр Иванович продолжил в качестве генерального директора отраслевого научного комплекса по животноводству, племенному делу и биотехнологии – директором Всероссийского института животноводства (1988 – 1992).
Основные его исследования посвящались вопросам разведения сельскохозяйственных животных и частной зоотехнии. Прудов является автором новой красно-пестрой породы молочного скота, нового типа холмогорского скота для центральной зоны России, автором трех ГОСТов по качеству молока. Александр Иванович опубликовал свыше 200 научных работ, 7 монографий, которые были опубликованы не только в России, но и в Индии, Австралии, Канаде, Дании, Польше. Имел два авторских свидетельства и два патента на новые породы скота.
Александр Иванович Прудов – заслуженный деятель науки России. Награжден медалью «За доблестный труд в Великой Отечественной войне 1941-1945 годов», отмечен семью золотыми и серебряными медалями ВДНХ, принят в число академиков Нью-Йоркской академии наук.
